La estación del Tren de Pasajeros en Salamanca se ubicará en el derecho de vía de la autopista 45D, al norte de Salamanca, a tan solo 25 minutos a pie del de la zona centro de este municipio que contará con un nuevo trazo de vía para este proyecto. Lo anterior se informó durante la colocación de la primera piedra, del Tren de Pasajeros en su tramo e Querétaro a Irapuato.
Andrés Lajous Loaeza titular de la Agencia Reguladora del Transporte Ferroviario informó que las estaciones más grandes serán las de Irapuato y Celaya, por ser lugares que tienen más demanda; mientras que las de Cortázar, Apaseo y Salamanca, serán más pequeñas "Digo la zona norte de salamanca, porque físicamente es la norte, pero del centro de Salamanca estamos hablando de que es una caminata de 20, 25 minutos sigue siendo dentro de la zona urbana (?) este último tramo no vamos sobre el derecho de vía ferroviario, sino que vamos sobre el derecho de vía de la carretera 45D, pero al llegar a Irapuato volvemos a entrar al derecho de vía ferroviario para ya poder entrar a la ciudad".
El Tren Querétaro-Irapuato contará con cuatro estaciones en Salamanca, además de que los trenes que recorrerán esta ruta tendrán velocidades máximas de 160 a 200 kilómetros por hora (km/h).