Cartel Chamula opera hasta en zona fronteriza.
En los Altos de Chiapas el Cártel San Juan Chamula (CSJC), controla gran parte de la producción y distribución de estupefacientes.
Robo de vehículos y autopartes; el tráfico de persona, armas, combustible y madera, así como la venta de material de la denominada etno-pornografía.
El cartel Chamula, incluso fue recientemente reconocido como tal por la federación, al responsabilizarlos de la muerte de Fiscal de Justicia Indígena Gregorio Pérez Gómez de San Cristóbal de Las Casas.
De acuerdo a investigadores locales en materia de narcotráfico, la nueva célula delictiva que surgió en la región tsotsil chamula se ha extendido en una franja que atraviesa la frontera con Guatemala, sube hacia Comitán, penetra en la Selva, se dirige hacia Los Altos y avanza sobre puntos estratégicos como:
San Andrés Larráinzar, Chenalhó, Pantelhó, Mitontic, Jitotol y Pueblo Nuevo Solistahuacán, estos municipios son atajos que desembocan en el Golfo de México, a donde llega toda la mercancía ilícita.
A principios del año 2000, el cártel de Los Zetas se posicionó en territorio chiapaneco; la violencia con la que irrumpieron sus integrantes amedrentó y doblegó a ciudadanos y autoridades municipales y estatales, pero en el municipio indígena de San JuanChamula, aprendieron a no temerles y sus habitantes comenzaron a imitar sus delitos.
"Los carteles de droga se vuelven más fuertes no solo por el cobro de los ingresos ilegales que obtienen como el cobro de piso, sino también por el poder que ejercen a través del reclutamiento criminal en las comunidades, así logran someterlos."
Cabe hacer mención que en los diferentes mercados públicos de San Cristóbal de Las Casas se ofertan los discos compactos de filmes caseros con mujeres indígenas teniendo relaciones sexuales; por lo regular, ellas son grabadas sin su consentimiento y a la fecha, las autoridades federales no han realizado operativos concretos para combatir este y otros ilícitos del fuero federal.