De acuerdo al último reporte de los Indicadores de la calidad del agua superficial a nivel nacional realizado en 2022, de los 41 cuerpos de agua monitoreados en la entidad, entre los que se encuentran ríos, lagos, canales, presas y arroyos; 30 se encuentran fuertemente contaminados o contaminados.
Sólo 12 están dentro del rango de aceptable, buena calidad y excelente, entre ellos se encuentran, la presa de Villa Victoria, La presa de Valle de Bravo, Río Ñadó y la Presa Madin.